Phòng Khoa học và Hợp tác quốc tế được thành lập theo quyết định 373/QĐ-KHNN-TCCB ngày 29/5/2006 của Giám đốc Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam
Trưởng phòng: TS. Nguyễn Văn Toàn
Bộ môn Khoa học đất và sinh thái vùng cao được thành lập theo mục “b” phần “3” điều “3” Quyết định số 08 /2006/QĐ- BNN ngày 06 tháng 2 năm 2006 của Bộ trưởng Bộ nông nghiệp và PTNT.
Trưởng bộ môn: Phó Viện trưởng T.S Hà Đình Tuấn
Bộ môn Công nghệ sau thu hoạch được thành lập theo mục “f ” phần “3” điều “3”quyết định số 08/2006/QĐ – BNN ngày 6 tháng 2 năm 2006 của Bộ trưởng Bộ Nông nghiệp và PTNT.
Trưởng bộ môn: Th.S Ngô Xuân Cường
Bộ môn Công nghệ sinh học và nhân giống được thành lập theo mục “e ” phần “3” điều “3”quyết định số 08/2006/QĐ – BNN ngày 6 tháng 2 năm 2006 của Bộ trưởng Bộ Nông nghiệp và PTNT
Trưởng Bộ môn: TS Nguyễn Văn Thiệp
Bộ môn Hệ thống nông nghiệp được thành lập theo mục “d” phần “3” điều “3”quyết định số 08/2006/QĐ – BNN ngày 6 tháng 2 năm 2006 của Bộ trưởng Bộ Nông nghiệp và PTNT.
Trưởng Bộ môn: TS. Đặng Đình Quang
Trung tâm Nghiên cứu và Phát triển Chè được thành lập theo mục “c” phần “4” điều “3” trong Quyết định số 08 /2006/QĐ- BNN ngày 06 tháng 2 năm 2006 của Bộ trưởng Bộ nông nghiệp và PTNT.
Giám đốc Trung tâm: Phó Viện trưởng TS. Đỗ Văn Ngọc